El museo se encuentran en Managua, cerca de la ribera sur del lago Managua en una zona llamada El Cauce. Se puede observar huellas fósiles del periodo Holoceno tardío que fueron hechas por pobladores de la zona en la ceniza y el fango volcánicos que solidificaron hace 2120 años (±120), poco después de que un grupo de quince individuos pasaran por allí.

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